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Dúvida
Como gerar o CST - Código de Situação Tributária de PIS - Programa de Integração Social, COFINS - Contribuição para Financiamento da Seguridade Social e IPI - Imposto sobre Produtos Industrializados para notas fiscais e fretes em período aberto ou fechado?

Ambiente
Cross Segmentos - TOTVS Backoffice (Linha Logix) - Recebimento - Versão 12

Solução
Para geração do CST pode ser utilizado o programa SUP1284 - Gera CST PIS/COFINS/IPI. 
Funcionamento do programa:

Processamento geral - botão Informar e Processar:

Deve ser informado na tela principal do SUP1284 o período que deve ser processado. Ao processar, é apresentada mensagem: Deseja re-processar todas as NFs mesmo que possuam CST IPI/PIS/COFINS informado? Clique em Sim pra confirmar Clique em Não pra processar apenas as NFs que não possuem CST informado.
Na opção Sim o programa processa todas as notas e fretes do período mesmo que essas já possuam CST, incluindo ou alterando o CST de acordo com a classificação do item e a configuração fiscal.
Na opção Não o programa processa o CST apenas para as notas e fretes que ainda não possuem essa informação.
Ao final do processamento, se todas as notas e fretes tiveram CST incluso ou alterado corretamente, o programa mostra em tela a mensagem: Processo executado com sucesso!.
Caso durante o processamento o programa não encontre configuração fiscal válida para determinada nota ou frete, é apresentada a mensagem: Foram encontradas inconsistências durante a geração de CST: IPI/PIS/COFINS. Deseja emitir o relatório de inconsistências?. No relatório gerado será impresso o número do AR - Aviso de Recebimento e/ou frete, sequência do item e a mensagem de inconsistência.

Processamento específico - botão Altera CST:

Essa opção permite alterar o CST de PIS e COFINS de um valor para outro, para atender os casos em que o CST pode sofrer alteração mensalmente de acordo com os tipos de receitas do período - Receitas tributadas e não-tributadas no mercado interno e de exportação. Pode ser informado um período ou as notas fiscais.
A validação feita nessa opção é a mesma feita no processamento geral do programa.

Saiba mais
Para a inclusão do CST no frete ou na nota fiscal, o SUP1284 se baseia na configuração fiscal do VDP0692/VDP10064 - Tributos e Benefícios e VDP0696/VDP10068 - Configuração Fiscal. Mais informações nos artigos:

• Cross Segmentos - Linha Logix - SUP - Parametrizar o CST de PIS, COFINS, IPI e ICMS na nota fiscal de entrada
• Cross Segmentos - Linha Logix - SUP - Parametrizar o CST de PIS, COFINS e ICMS para frete